Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe40O35185 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms