Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Scarb2O35114 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Scarb2O35114 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Scarb2O35114 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Scarb2O35114 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Scarb2O35114 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Scarb2O35114 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarb2O35114 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Scarb2O35114 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Scarb2O35114 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Scarb2O35114 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Scarb2O35114 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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