Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha8O09127 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Epha8O09127 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Epha8O09127 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Epha8O09127 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha8O09127 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha8O09127 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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