Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb1O09061 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Psmb1O09061 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb1O09061 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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