Protein–RNA interactions for Protein: O08692

Ngp, Neutrophilic granule protein, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgpO08692 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgpO08692 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgpO08692 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgpO08692 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgpO08692 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NgpO08692 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgpO08692 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgpO08692 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgpO08692 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgpO08692 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgpO08692 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgpO08692 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NgpO08692 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgpO08692 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgpO08692 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms