Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21310J3QQ23 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21310J3QQ23 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21310J3QQ23 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21310J3QQ23 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21310J3QQ23 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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