Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5225J3QPL3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5225J3QPL3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms