Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5849J3QPE5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm5849J3QPE5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm5849J3QPE5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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