Protein–RNA interactions for Protein: J3QNT6

Gm5039, Predicted gene 5039, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5039J3QNT6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5039J3QNT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms