Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm17577J3QNF7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm17577J3QNF7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm17577J3QNF7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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