Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp616J3QN14 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp616J3QN14 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp616J3QN14 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp616J3QN14 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp616J3QN14 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp616J3QN14 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp616J3QN14 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp616J3QN14 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp616J3QN14 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp616J3QN14 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp616J3QN14 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms