Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms