Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6594J3QM43 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6594J3QM43 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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