Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms