Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp17lcG5E8I7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17lcG5E8I7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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