Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933406M09RikG3XA12 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933406M09RikG3XA12 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms