Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcf11G3X9Z4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcf11G3X9Z4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcf11G3X9Z4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms