Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmgxb3G3X9M3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms