Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx1-1G3UXB3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx1-1G3UXB3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx1-1G3UXB3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx1-1G3UXB3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx1-1G3UXB3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx1-1G3UXB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx1-1G3UXB3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx1-1G3UXB3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms