Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms