Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Colca2F8VPY8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms