Protein–RNA interactions for Protein: F7C9A1

Gm3327, Predicted gene 3327 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3327F7C9A1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3327F7C9A1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms