Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28038F7BCN9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28038F7BCN9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28038F7BCN9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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