Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms