Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17555F6U8B9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms