Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm340F6RGI3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms