Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prl3d2F6R3P9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prl3d2F6R3P9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prl3d2F6R3P9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prl3d2F6R3P9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prl3d2F6R3P9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prl3d2F6R3P9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prl3d2F6R3P9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d2F6R3P9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d2F6R3P9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms