Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4E9QAP7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf4E9QAP7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms