Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms