Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms