Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TrdnE9Q9K5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms