Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms