Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms