Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Simc1E9Q6E9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Simc1E9Q6E9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms