Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DspE9Q557 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DspE9Q557 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms