Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trip11E9Q512 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms