Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms