Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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