Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms