Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tarbp1E9Q368 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms