Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430401F13RikE9Q328 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms