Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms