Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx60E9PZQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Ddx60E9PZQ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Ddx60E9PZQ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Ddx60E9PZQ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Ddx60E9PZQ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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