Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gimd1E9PW74 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gimd1E9PW74 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms