Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms