Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms