Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifit3bE9PV48 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms