Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clca3bE9PUL3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms