Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms