Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3543D3Z235 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3543D3Z235 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3543D3Z235 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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